O cão mais medroso do mundo está de volta envolvido na investigação dos maiores mistérios. Aqui são quatro mistérios escolhidos pelos próprios fãs. Podemos ver o cão e sua turma investigando o caso envolvendo o fantasma do assustador Capitão Cutler em Uma Pista Para Scooby-Doo. Depois, ele a turma da Mistério S.A. tentam desvendar o que teria acontecido com a tripulação de uma embarcação desaparecida em Mistério em Alto-mar. Já em Quem É o Ladrão? eles descobrem o paradeiro de um perigoso ladrão de bancos. Para encerrar, os veja subirem ao palco para acabarem com a graça de acrobatas meio malucos em Um Salto Para o Mistério.